Jean-Yves Faberon a soutenu sa thèse de droit public en 1976 sur les institutions politiques de l’Algérie indépendante, à la Faculté de droit de Montpellier, où il a commencé sa carrière universitaire. Il y a créé l’Institut de droit d’outre-mer. Il a ensuite rejoint l’Université de Nouméa. Il a fondé en 2003 la Revue Juridique Politique et Économique de Nouvelle-Calédonie dont il est toujours le directeur scientifique. Il a organisé de nombreux colloques sur les questions posées par les outre-mers. Il est l’auteur notamment de Pieds-Noirs en Nouvelle-Calédonie (2012) et de D’Algérie (2018), tous deux publiés aux éditions L’Harmattan.